وقتی نام دانشمند همدانی در فهرست پاداش‌های دولتی قرار می‌گیرد اینجا بود که فهرستی از پاداش‌ها که به واسطه‌ی اهدای نشان‌های دولتی در دوره دکتر احمدی‌نژاد پرداخته شده بود به وسط معرکه وارد شد. در این فهرست نام پرفسور محمدعلی زلفی گل استاد دانشگاه بوعلی سینا نیز دیده می شود. در این فهرست، مقابل اسم ایشان نوشته شده است نشان درجه ۲ پژوهش. هدیه‌ی این نشان، ۷۵ سکه، معادل ۵۶ میلیون تومان می باشد. اینکه این مبلغ پاداش بوده و نه حقوق ماهانه مسئله مورد بحث نیست.